دشن بنك "مصر" خدمة جديدة لسداد الضرائب والجمارك وذلك بالتعاون مع المسئولين عن سداد المدفوعات الحكومة والهيئات الحكومية بوزارة المالية، ويأتى ذلك انطلاقاً من دور بنك مصر الريادي في تقديم الخدمات، هذا ويتيح البنك خدمة سداد الضرائب والجمارك من خلال 281 فرعًا.

 ومن المزايا التي تمنحها خدمة سداد الضرائب للأفراد والمؤسسات، تجنيب العميل المخاطر وتبسيط عملية السداد، وذلك عن طريق السداد المباشر لحساب العميل، مع إعطاء العميل مستنداً يفيد قيامه بالسداد، ولم يقتصر الأمر عند هذا الحد بل يمكن للعميل السداد بوسائل مختلفة (نقدا أو خصماً من الحساب الجارى)، فضلا عن إتاحة الخدمة للعملاء وغير العملاء،  وأخيرا تواجد عدد كبير من منافذ للسداد، كما تسهم الخدمة في توفر عنصري الأمان والسرعة للعميل وذلك لعدم  التقيد بالسداد داخل المأمورية المسجل بها، وعدم الالتزام بالتوزيع الجغرافي  في إطار التيسير على الممولين وتحقيق اللامركزية في تحصيل الضرائب، وعدم المخاطرة في حمل الأموال للسداد.

 أما بالنسبة لخدمة سداد الرسوم الجمركية فقد كان بنك مصر أول بنك في مصر يتيح السداد للجمارك سواء للأفراد أو الهيئات الحكومية منذ ديسمبر 2005، حيث تمكن هذه الخدمة العميل من الاستعلام عن الرسوم الجمركية المستحقة عليه أو على مؤسسته و سدادها من خلال فروع البنك والتى تقدم هذه الخدمة , حيث يتم التأشير الفورى على بيانات العميل بما يفيد السداد.